感染性腹瀉的主要感染途徑都是通過消化道傳播，因此預防措施主要是把好“病從口入”這一關。

要加強飲食、水源、食品的衛生管理和滅蠅工作，對垃圾糞便進行無害化處理。在洪澇災害后要特別注意管好水源和糞便，水井應加井蓋或蓋水房，廁所要建提離水源遠一些，以防止糞便從地下滲到水源，造成霍亂弧菌、痢疾桿菌等腸道感染性細胞污染飲用水。

? 集體餐飲單位要特別注意食品的安全和衛生。餐飲工作人員一定要定期檢查身體，發現的帶菌者，必須暫時調離工作徹底治療，以杜絕傳染源。食物加工應按衛生規范進行，生熟食物要分開，餐具要洗凈、消毒。發生群體性腹瀉流行的餐飲單位或公共場所要立即關閉，流行過后應進行終末消毒后方可開放。

? 對于個人，要愛清潔，講衛生。飯前便后要洗手，生吃瓜果蔬菜要洗燙，不喝生水，不吃腐爛變質的食物，尤其是海鮮類食物容易受到各種細菌和病毒的污染，最好不要生吃。不要在沒有衛生許可證的小攤販那里買食物，夏季的涼菜最好自己在家中加工，熟食買回家后最好再進行加熱后停用。外出旅游不要過于勞累，在衛生條件較好的餐館進餐。嬰兒最好母乳喂養，奶瓶在每次用后都要洗凈、消毒。

? 家中發現腹瀉的病人要隔離治療，接觸腹瀉病人要用肥皂洗手，病人衣物要立即用肥皂水浸泡后清洗，用物要用含氯消毒液擦拭消毒。

霍亂和輪狀病毒感染都可以通過疫苗預防。從霍亂非疫區到疫區的旅游者可提前接種霍亂減毒或滅活疫苗，保護率在80%以上。

嬰兒輪狀病毒感染也已經有了預防的疫苗。世界衛生組織已將嬰兒輪狀病毒感染納入全球腹瀉病控制和免疫規劃，并建議將輪狀病毒疫苗列入各國兒童計劃免疫。