該病原體通過糞-口傳播，主要發生在嬰幼兒，所以又叫做“嬰幼兒秋季腹瀉”。當輪狀病毒侵犯小腸粘膜細胞時，會使這些細胞失去吸收腸腔里水和電解質的能力，水和電解質就會從體內排出，造成水樣腹瀉。因此，對嬰幼兒秋季腹瀉的治療、處理要對因治療，還要對腸道的微環境以及相關的癥狀進行對癥治療。

秋季腹瀉的主要臨床特征是：先吐后瀉，并伴有發熱，大便呈稀水樣或蛋花樣，病程有自限性，尚無特效藥治療。如腹瀉十分嚴重，補液又不及時，便容易出現脫水、電解質紊亂、營養吸收障礙等。

西醫治療中主要采取胃腸粘膜保護劑、微生態制劑、液體和電解質補充劑等藥物聯合治療。

胃腸粘膜保護劑是秋季腹瀉的首選藥物，它對輪狀病毒及其毒素有強大的吸附作用，并在腸粘膜表面形成保護層，修復和提高腸黏膜對致病因子的防御功能，起到止瀉的作用。常用的藥物有思密達（蒙脫石散），為避免本品使用時覆蓋其他藥物影響吸收，應與其他藥物間隔1小時以上使用。

 微生態制劑常與胃腸粘膜保護劑聯合使用，效果更理想，其能調節腸道菌群，糾正菌群失調。常用的藥物有媽咪愛（枯草菌二聯活菌顆粒）、培菲康、金雙歧（雙歧桿菌三聯活菌膠囊）、常樂康（酪酸梭菌二聯活菌膠囊）、整腸生（地衣芽孢桿菌膠囊）、復方嗜酸乳桿菌片及布拉氏菌膠囊等。需要注意活菌制劑時與抗菌藥同服可減弱其療效，應間隔2小時以上。不能服用膠囊的幼兒，可取膠囊內容物粉末或研碎藥片后用涼開水、果汁或牛奶送服。

口服補液鹽有多種配方，WHO2002年推薦的低滲透壓配方口服補液鹽Ⅲ，口服補液鹽Ⅲ與傳統口服補液鹽相比減少了鈉和葡萄糖的含量，滲透壓由311mOsm/L降至 245mOsm/L。新配方可使腸道迅速吸收，不僅能減少靜脈輸液需求，并且能減少腹瀉量，起到補液和止瀉的雙重作用，使用低滲口服補液鹽治療腹瀉是最為簡便、有效和便宜的方法。口服補液鹽Ⅲ的用法用量為將一帶量溶解于250ml溫開水中，隨時口服。如果沒有口服補液鹽Ⅲ，也可以用口服補液鹽I或口服補液鹽II臨時替代。需要注意的是，嬰幼兒應用口服補液鹽時需少量多次給予。

杜拉寶（消旋卡多曲顆粒）能減少消化道內的水和電解質過度分泌，起到止瀉作用。

山莨菪堿片能解除胃腸道平滑肌痙攣、減少腺體分泌，改善腸道微循環，促進水分吸收，減輕輪狀病毒感染引起的吸收障礙性腹瀉癥狀。注意因該藥物副作用可能引起嬰幼兒面紅，口干，停藥或減量使用即可，并無不良影響。