2013年原國家食品藥品監督管理局發布的藥品不良反應信息（第55期）中便提醒警惕質子泵抑制劑與氫氯吡格雷的相互作用，已有相關臨床證據顯示合用某些質子泵抑制劑可降低氫氯吡格雷的療效，從而導致血栓不良事件增加，但各類質子泵抑制劑的抑制作用并不相同，以奧美拉唑對氫氯吡格雷的抑制作用最明顯。

而根據研究顯示，患者同時服用奧美拉唑與氫氯吡格雷，奧美拉唑可使氫氯吡格雷活性代謝物的血藥濃度下降，該血藥濃度下降可導致血小板聚集抑制率下降。

奧美拉唑具有酶抑制作用，可延緩經肝臟細胞色素 P450 系統代謝的藥物（如雙香豆素、地西泮、苯妥英鈉、華法林、硝苯定）在體內的消除。

當本藥品與上述藥物一起使用時，應酌情減輕后者用量。研究表明，服用地西泮期間，口服奧美拉唑可致步態紊亂，停用即可恢復正常。服用奧美拉唑一周后，可使單劑量注射地西泮的清除率降低 54%，血藥濃度升高。

奧美拉唑和地高辛合用后使得地高辛血藥濃度升高10%。可總結為奧美拉唑可降低胃液酸度，可能減少地高辛水解，增加其吸收。胃液pH<3時，地高辛在胃內水解，導致活性降低或喪失。

鐵劑主要是在十二指腸及空腸近端以亞鐵離子的形式吸收，胃酸可增加鐵劑的溶解度，促使不被吸收的三價鐵轉化為可被吸收的二價鐵，從而有助于鐵的吸收。

奧美拉唑屬于抑酸劑，可減少胃酸分泌，提高胃內 pH 。如果在服用鐵劑時同時服用抑酸劑，特別是強效抑酸劑，必然會影響鐵劑的吸收，降低療效。所以，在服用鐵劑糾正貧血期間最好停用奧美拉唑。

奧美拉唑通過抑制 H⁺-K⁺-ATP 酶的活性來發揮作用，而甲氨蝶呤的腎清除是通過氫離子依賴性機制進行的，因此懷疑甲氨蝶呤與奧美拉唑有相互作用，關于相互作用的資料有限。

由于聯用兩藥可能導致嚴重后果，應考慮停止奧美拉唑治療，密切監測血漿甲氨蝶呤濃度，并適當地采用亞葉酸解救、充分補液及堿化尿液。

奧美拉唑是脂溶性弱堿性藥物，可能降低酮康唑的生物利用度，減弱其抗真菌作用。

奧美拉唑可以降低地塞米松的胃腸道吸收。

奧美拉唑可影響鹽酸麻黃堿在尿中的排泄，增加鹽酸麻黃堿的半衰期，延長作用時間，特別是容易出現尿保持堿性數日或更長的情況，患者容易出現麻黃堿中毒的現象。

受奧美拉唑抑酶的影響，奧美拉唑可延緩硝苯地平在體內的消除，增強其藥理作用。

奧美拉唑為白色或者類白色疏松塊狀物或粉末，用專用溶劑稀釋后為無色透明溶液，而長春西汀為腦血管擴張藥物，兩藥物先后進行靜滴會發現原本澄清的液體會變渾濁，而隨著時間的逐漸推移溶液顏色逐漸加深，變色說明兩藥物溶液混合存在化學反應，這也進一步說明兩藥物間存在配伍禁忌。